Metsästäjät alkaa vuodesta 1994. Kaksoissisarukset löydetään raa'asti surmattuna kesämökiltä. Poliisin tutkimukset viittaavat läheisen sisäoppilaitoksen rikkaisiin poikiin, mutta tutkimukset loppuvat kun paikallinen poika tunnustaa murhat ja saa tuomion niistä. 20 vuotta myöhemmin juttu päätyy komisario Carl Mørckin pöydälle ja hän huomaa heti, että kaikki ei täsmää. Carl ja hänen alaisensa Assad sekä uusi sihteeri Rose käynnistävät tutkinnan uudestaan ja löytävät vanhan hätäpuhelun epätoivoiselta tytöltä, joka tietää murhista. Kolmikko etsii pian kuumeisesti Kimmie-tyttöä, joka katosi murhan aikaan. Tytön tiedot uhkaavat tiettyjä vaikutusvaltaisia yhteiskunnan päättäjiä, jotka tekevät kaikkensa etteivät menneisyyden varjot saa heitä kiinni.